一、基本信息
产品编号:D6305/D6306
核心特点:组成明确、杂质极低、GC含量范围广
产品描述:ZymoBIOMICS®微生物群落DNA标准品是由八种细菌和两种真菌纯培养物中分离的基因组DNA混合物。其基因组GC含量覆盖15%至85%的广泛范围,经过精确表征,外源微生物DNA杂质含量低于0.01%。该标准品适用于评估和揭示微生物组学或宏基因组学工作流程中的技术假象、误差和偏好性。
二、产品应用
ZymoBIOMICS®微生物群落DNA标准品主要用于评估和优化基于二代测序的微生物组分析流程。
△工作流程基准测试:作为已知组成的标准品,用于评估从文库制备、测序到生物信息学分析全流程的准确性与重复性。
△方法学偏差评估:用于检测和量化由GC含量差异、PCR嵌合体形成或扩增偏好性等因素引入的分析偏差。
△实验室间质控:作为标准参照物,用于不同实验室间研究结果的比较与质量控制。
△生物信息学工具验证:为物种分类鉴定算法和群落组成分析流程的准确性评估提供已知真值的数据集。
三、产品优势
✅组成明确:包含八种细菌和两种真菌的基因组DNA,其理论相对丰度已知,为结果分析提供精确参照。
✅杂质极低:保证外源微生物DNA污染水平低于0.01%,确保检测信号来源于标准品本身。
✅GC覆盖广:所含微生物基因组的GC含量范围涵盖15%至85%,可用于全面评估实验方法对不同GC含量样本的偏好性。
✅数据支持完备:提供所有菌株的参考基因组及16S/18S rRNA基因序列文件,便于用户进行深入的生物信息学比对与分析。
四、使用说明(实验流程概要)
1. 样品解冻:将标准品置于冰上融化。完全融化后,进行短暂涡旋振荡,并快速离心使管壁液体聚集。
2. 用量确定:根据待评估的特定文库制备流程,确定所需DNA上样量。具体用量可参考产品说明中的示例。
3. 数据分析:使用MIQ Score在线分析工具对标准品产生的原始测序数据进行分析,以评估整个NGS分析流程中潜在的偏好性和不准确性。
五、注意事项
1. 储存条件:产品需保存于-20°C。避免反复冻融,建议根据实验需求进行分装。
2. 实验操作:本产品仅供研究使用,应由受过培训的专业人员在实验室内操作,不适用于诊断程序。
3. 安全防护:实验过程中请佩戴手套和护目镜等个人防护装备,并严格遵守所在机构的安全操作规程。
4. 数据解读:分析结果时,需结合产品提供的理论组成和参考基因组信息,对观测到的偏差进行合理解释。
六、相关产品推荐
1. ZymoBIOMICS®微生物群落标准品(货号:D6300):包含完整微生物细胞的混合物标准品,用于评估从样本处理到DNA提取的全流程。
2. ZymoBIOMICS®微生物群落标准品II(对数分布)(货号:D6310):微生物组成呈对数级丰度分布的细胞混合物,用于评估方法对低丰度物种的检测能力。
3. ZymoBIOMICS®肠道微生物组标准品(货号:D6331):模拟肠道微生物群落组成的标准品,专门用于肠道相关研究的流程验证。