一、基本信息
产品编号:D6331
核心特点:模拟真实肠道菌群、跨物种覆盖、高纯度标准品
产品描述:ZymoBIOMICS® 肠道微生物组标准品由21种微生物菌株(包括细菌、古菌和真菌)经完全灭活后混合制成,旨在模拟人体肠道微生物组,用于评估和验证基于二代测序的微生物组成分析流程中的偏差与误差。
二、产品应用
ZymoBIOMICS® 肠道微生物组标准品主要用于评估基于NGS的微生物组分析流程的性能。
△流程验证与基准测试:用于评估从样本处理到生物信息学分析的整个微生物组工作流程的准确性与可重复性。
△方法学比较与优化:为不同DNA提取方法、测序平台或生物信息学流程提供统一的性能评估标准。
△实验室质量控制:作为内部质控品,监测实验室间或实验批次间的技术变异。
△生物信息学工具评估:用于测试生物信息学流程在物种鉴定、丰度定量和低丰度物种检测方面的准确性。
三、产品优势
✅真实性:包含18种细菌、2种真菌和1种古菌,其组成设计旨在模拟真实的人类肠道微生物生态。
✅挑战性:整合了难裂解的革兰氏阳性菌、宽范围GC含量的基因组、低丰度病原体以及用于测试分类分辨率的5种不同大肠杆菌菌株。
✅高纯度:经过严格表征,外源微生物DNA杂质含量低于0.01%,确保了标准品背景的洁净度。
✅准确性:各组分菌株在混合前均经过精确定量,混合后组成经NGS测序验证,理论组成与实测组成平均相对丰度偏差小于15%。
✅安全性:所有微生物均已完全灭活,不属于生物危害材料,便于安全运输与操作。
四、使用说明(实验流程概要)
1. 解冻:将标准品置于冰上完全解冻。
2. 混匀:解冻后涡旋振荡至少30秒,随后短暂离心。
3. 取样:每次提取使用75 µL标准品。
4. 裂解:推荐使用包含机械裂解步骤的微生物DNA提取试剂盒(如ZymoBIOMICS® DNA Miniprep Kit, D4300)以实现无偏且高效的DNA分离。
5. 预期产量:使用推荐试剂盒时,每次提取的预期DNA产量约为1 µg。
五、注意事项
1. 储存:产品需保存于-80°C,并避免反复冻融。
2. 用量:每次提取建议使用75 µL,以确保获得足量且具有代表性的DNA。
3. 裂解方法:为克服标准品中难裂解微生物(如革兰氏阳性菌)的挑战,强烈建议采用包含机械破碎(如 bead-beating)的DNA提取方案。
4. 数据分析:建议使用产品提供的参考基因组与16S/18S rRNA基因序列文件进行生物信息学分析,以准确评估流程性能。
5. 用途限定:本产品仅供研究使用,不适用于诊断程序,且必须由经过培训的专业人员操作。
六、相关产品推荐
1. ZymoBIOMICS® 微生物群落标准品(货号:D6300):包含已知比例的8种细菌,用于微生物组测序流程的基准测试。
2. ZymoBIOMICS® 微生物群落DNA标准品(货号:D6305/D6306):提供不同定量的预提取DNA,用于直接评估测序与生物信息学步骤。
3. ZymoBIOMICS® 微生物群落标准品II(对数分布)(货号:D6310):包含10种细菌,其丰度呈对数梯度分布,用于评估检测动态范围。
4. ZymoBIOMICS® 高分子量DNA标准品(货号:D6322):提供已知大小分布的高质量DNA,用于评估长读长测序或宏基因组组装流程。